Церква входить в комплекс монастиря св. Онуфрія. На жаль, ранній період її будівельної історії - до XVI ст. - не вияснений. Ще за князя Льва Даниловича тут, мабуть, була дерев’яна церква, при якій поселилися ченці. У 1463 р. монастир обновив львівський міщанин Степан Дропан. Майже через століття, близько 1550 р., як доводять історики, князь Костянтин Острозький на місці дерев’яної збудував муровану церкву, що стала ядром сучасної споруди. Спершу храм складався з двох частин, які до XVIII ст. не були з’єднані між собою: основної - так званої "великої церкви" І Троїцької каплиці з південної сторони - "малої церкви". Після багатьох руйнувань від пожеж та воєн пам’ятку постійно відбудовували. Найґрунтовніше реставрацію здійснено в 1680 р., після турецької облоги 1672 р. У 1701 р. стараннями Анни Красовської, дружини діяльного члена Успенського Ставропігійського братства Миколи Красовського, розширено Троїцьку каплицю. Під час реконструкції 1776 р., проведеної архітектором Францом Кульчицьким, між "великою церквою" і каплицею пробито стіну і з’єднано ці дві споруди в одну. В 1821 -1824 рр. Під керівництвом архітектора Франца Трешера розширено на чотири сажні у східному напрямі вівтарну частину, добудовано сакристію і притвор. Нарешті в 1902 р. за проектом архітектора Едгара Ковача будівничий Іван Левинський спорудив північний неф, повторивши форму південної каплиці, внаслідок чого церква стала тринефною. Монастирський будинок був побудований на давній території князівського Львова, біля підніжжя Замкової гори. Створює єдиний архітектурний комплекс з церквою св. Онуфрия Великого і вежею-дзвіницею. Не має ознак єдиного стилю : будівництво велося в різні періоди. Основні дати будівництва : 1683; 1693-1698 (спорудження оборонних стін); кінець XVIII - почало XIX ст. (перебудови, зміни внутрішнє планування будівлі); 1998 (реставрація з частковою реконструкцією). Келии цегляні, двоповерхові, в плані - витягнутий прямокутник. З півночі до будівлі примикає дзвіниця. Частково збе?еглися зведення в приміщеннях першого і другого поверхів.