За лаврським переказом, засновником обителі вважають Кн. Андрія Боголюбського, який був прозваний Китаєм. Монастир діяв в 18 - початку 20 ст.; відновлений в 1990-і роки. Документована історія обителі починається з 1716 р. Найбільш відомими з китаєвських старців були Досифей і Феофіл. Степан Ковнір в 1763-68 рр. побудував в монастирі один з останніх пам'ятників українського бароко - церкву Трійці. У 1920-і роки храми продовжували діяти, але сама пустель вже не належала ченцям: у келіях розмістили дитячу колонію. У 1930 р. пустель була остаточно ліквідована, територія і споруди передані Українському НДІ садівництва. Після реставрації в 1992 р. Троїцька церква була передана УПЦ. З 1996 р. обитель має статус самостійного монастиря.